Чи­стая линия  — груп­па ор­га­низ­мов, име­ю­щих не­ко­то­рые при­зна­ки, ко­то­рые пол­но­стью пе­ре­да­ют­ся потом­ству в силу ге­не­ти­че­ской од­но­род­но­сти всех осо­бей. В слу­чае гена, име­ю­ще­го не­сколь­ко ал­ле­лей, все ор­га­низ­мы, от­но­ся­щи­е­ся к одной чи­стой линии, яв­ля­ют­ся го­мо­зи­гот­ны­ми по од­но­му и тому же ал­ле­лю дан­но­го гена.

Чи­сты­ми ли­ни­я­ми часто на­зы­ва­ют сорта рас­те­ний, при са­мо­опы­ле­нии да­ю­щих ге­не­ти­че­ски иден­тич­ное и мор­фо­ло­ги­че­ски сход­ное потом­ство.