Ли­шай­ни­ки могут раз­мно­жать­ся всеми пе­ре­чис­лен­ны­ми спо­со­ба­ми.

Споры ли­шай­ни­ко­во­го гриба, вы­бра­сы­ва­е­мые из пе­ри­те­ци­ев и апо­те­ци­ев, про­рас­та­ют в гифы, ко­то­рые, пе­ре­пле­та­ясь, об­ра­зу­ют за­ча­точ­ный тал­лом ли­шай­ни­ка, или про­то­тал­лом. При опре­де­лен­ных усло­ви­ях из него воз­ни­ка­ет на­сто­я­щий ли­шай­ник. Од­на­ко со­че­та­ние не­об­хо­ди­мых для этого усло­вий в при­ро­де встре­ча­ет­ся редко.

Более важны для раз­мно­же­ния ли­шай­ни­ков об­ра­зо­ва­ния, в ко­то­рых од­но­вре­мен­но при­сут­ству­ют гифы гриба и клет­ки во­до­рос­ли. Это со­ре­дии и изи­дии. Они слу­жат для раз­мно­же­ния ли­шай­ни­ка как це­ло­го ор­га­низ­ма. Попав в бла­го­при­ят­ные усло­вия, они дают на­ча­ло не­по­сред­ствен­но но­во­му тал­ло­му. Со­ре­дии и изи­дии встре­ча­ют­ся чаще у ли­сто­ва­тых и ку­сти­стых ли­шай­ни­ков.

Мно­гие ли­шай­ни­ки не об­ра­зу­ют апо­те­ци­ев, со­ре­дий и изи­дий и раз­мно­жа­ют­ся участ­ка­ми тал­ло­ма, ко­то­рые легко от­ла­мы­ва­ют­ся от хруп­ких в сухую по­го­ду ли­шай­ни­ков вет­ром или жи­вот­ны­ми и ими же пе­ре­но­сят­ся. Осо­бен­но ши­ро­ко рас­про­стра­не­но раз­мно­же­ние ли­шай­ни­ков участ­ка­ми тал­ло­ма в арк­ти­че­ских об­ла­стях.