Рыхление почвы под кроной плодовых деревьев — это воздействие на растения фактора
Антропогенный фактор — случайное или преднамеренное воздействие человека на организмы (прямое) или воздействие на организмы через изменение человеком их среды обитания (опосредованное).
Абиотические факторы — или факторы неживой природы; например, климатические, температурные условия, влажность, освещенность, химический состав атмосферы, почвы, воды, особенности рельефа.
Биотические факторы — все организмы и непосредственные продукты их жизнедеятельности. Организмы одного вида вступают в различные по характеру отношения, как друг с другом, так и с представителями других видов.
Экологические факторы характеризуются интенсивностью действия, оптимальностью значения (оптимумом), максимальным и минимальным значениями, в пределах которых возможна жизнь конкретного организма.
Фактор, значение которого в данный момент находится на пределах выносливости, или выходит за них называется ограничивающим (лимитирующим).
(Г. И. Лернер «Биология. Полный справочник для подготовки к ЕГЭ»)


но ведь рыхлить почву может не только человек. могут и дождевые черви, кроты, личинки и т.д. а это уже биотический фактор
Рыхление почвы под кроной плодовых деревьев предполагает, что делается это в агроценнозе, сознательно - человеком.
Некорректный вопрос, низкий процент того, что экзаменуемый догадается до того, что предполагает рыхление почвы под плодовыми деревьями
Что "плодовые деревья" — указано в вопросе... тут нечего "догадываться", нужно читать конкетный вопрос, а не додумывать его.
В вопросе нет ни намека на человека, соглашусь, что рыхлить мог и крот, и червь, и кто-либо еще. По-вашему, только люди под плодовыми деревьями копают? Ставьте вопрос корректней.
Авторы сайта не являются составителями вопросов. Именно в таком виде задание и ответы были даны в Основной волне ЕГЭ 2013 года. Поэтому мы предъявляем его вам в авторской формулировке, снабдив необходимыми комментариями.