В ос­но­ве ге­те­ро­зи­са лежит рез­кое по­вы­ше­ние ге­те­ро­зи­гот­но­сти у ги­бри­дов пер­во­го по­ко­ле­ния и пре­вос­ход­ство ге­те­ро­зи­гот по опре­делённым генам над со­от­вет­ству­ю­щи­ми го­мо­зи­го­та­ми. Чи­стая линия  — это груп­па рас­те­ний, яв­ля­ю­щих­ся по­том­ка­ми одной го­мо­зи­гот­ной са­мо­опы­ля­е­мой особи.